（三）這里需要注意的是，扣減進(jìn)項(xiàng)稅額的計(jì)算依據(jù)不是按該貨物、應(yīng)稅服務(wù)或者應(yīng)稅服務(wù)的原來的進(jìn)價(jià)，而是按發(fā)生上述行為的當(dāng)期實(shí)際成本計(jì)算。實(shí)際成本是企業(yè)在取得各項(xiàng)財(cái)產(chǎn)時(shí)付出的采購成本、加工成本以及達(dá)到目前場(chǎng)所和狀態(tài)所發(fā)生的其他成本，是相對(duì)于歷史成本的一個(gè)概念。
　　如試點(diǎn)地區(qū)某運(yùn)輸企業(yè)2012年1月購入一輛車輛作為運(yùn)輸工具，車輛不含稅價(jià)格為30萬元，增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅款為5.1萬元，企業(yè)對(duì)增值稅發(fā)票進(jìn)行了認(rèn)證抵扣。2013年12月，由于經(jīng)營(yíng)需要，運(yùn)輸企業(yè)將車輛作為接送員工上下班工具使用。車輛折舊期限為5年，采用直線法折舊。該運(yùn)輸企業(yè)需將原已抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額按照實(shí)際成本進(jìn)行扣減，扣減的進(jìn)項(xiàng)稅額為5.1÷5×3＝3.06萬元。
　　
　　第二十八條　納稅人提供的適用一般計(jì)稅方法計(jì)稅的應(yīng)稅服務(wù)，因服務(wù)中止或者折讓而退還給購買方的增值稅額，應(yīng)從當(dāng)期的銷項(xiàng)稅額中扣減；發(fā)生服務(wù)中止、購進(jìn)貨物退出、折讓而收回的增值稅額，應(yīng)從當(dāng)期的進(jìn)項(xiàng)稅額中扣減。
　　
　　本條是對(duì)納稅人扣減銷項(xiàng)稅額和進(jìn)項(xiàng)稅額的規(guī)定。這一條款體現(xiàn)了權(quán)利與義務(wù)對(duì)等的原則，從銷售方的角度看，發(fā)生服務(wù)中止或折讓時(shí)，計(jì)算征收增值稅的銷售額減少，因此可以扣減自己的銷項(xiàng)稅額，減少納稅義務(wù)。而從購買方的角度看，發(fā)生服務(wù)中止、購進(jìn)貨物退出或折讓時(shí)對(duì)方應(yīng)納增值稅減少，相應(yīng)要扣減自己的進(jìn)項(xiàng)稅額。這樣做，可以保證銷貨方按照扣減后的稅額計(jì)稅，購買方同樣按照扣減后的進(jìn)項(xiàng)稅額申報(bào)抵扣，避免銷售方減少了銷項(xiàng)稅額但購買方不減少進(jìn)項(xiàng)稅額的情況發(fā)生，保證國家稅款能夠足額征收。
　　
　　第二十九條　有下列情形之一者，應(yīng)當(dāng)按照銷售額和增值稅稅率計(jì)算應(yīng)納稅額，不得抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票：
　　（一）一般納稅人會(huì)計(jì)核算不健全，或者不能夠提供準(zhǔn)確稅務(wù)資料的；
　　（二）應(yīng)當(dāng)申請(qǐng)辦理一般納稅人資格認(rèn)定而未申請(qǐng)的。
　　
　　為了加強(qiáng)對(duì)符合一般納稅人條件的納稅人的管理，防止他們利用一般納稅人和小規(guī)模納稅人的兩種不同的征稅辦法達(dá)到少繳稅的目的，實(shí)施辦法制定了一項(xiàng)特殊的制度。對(duì)一般納稅人會(huì)計(jì)核算不健全，或者不能夠提供準(zhǔn)確稅務(wù)資料的，對(duì)試點(diǎn)納稅人銷售額超過小規(guī)模納稅人標(biāo)準(zhǔn)，未申請(qǐng)辦理一般納稅人認(rèn)定手續(xù)的，要按銷售額依照增值稅稅率計(jì)算應(yīng)納稅額，不得抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票。
　　這項(xiàng)措施是一項(xiàng)帶有懲罰性質(zhì)的政策，其目的在于防止納稅人利用一般納稅人和小規(guī)模納稅人兩種不同的征稅辦法少繳稅款。此外，本條第一款進(jìn)一步明確了會(huì)計(jì)核算不健全的情況，只適用于一般納稅人。